Lorsque le système s'arrête automatiquement ou manuellement, il est nécessaire de procéder à un lavage à l'eau pour le balayage de surface afin d'éviter que les ions de l'eau restant dans les gaines des membranes ne se précipitent sur la surface des membranes et ne provoquent des blocages. En outre, en fonction de la teneur en eau brute des membranes, le lavage chimique doit être effectué à certains intervalles lorsque le débit de production commence à diminuer. Le processus de lavage chimique a pour but d'empêcher le colmatage des membranes et de prolonger leur durée de vie. L'unité de lavage des membranes est utilisée à cette fin. CIP et la pompe sont calculés en fonction de la capacité du système.